Pneumonia terkait ventilator (VAP) yang disebabkan oleh Pseudomonas aeruginosa menimbulkan tantangan klinis yang signifikan karena pembentukan biofilm dan mekanisme resistensi patogen yang kuat. Klorheksidin (CHX), antiseptik yang umum digunakan, telah menunjukkan potensi dalam penghambatan biofilm, meskipun mekanisme pastinya masih belum jelas. Pekerjaan kami sebelumnya yang berfokus pada protein terkait penginderaan kuorum mengidentifikasi pengikatan CHX yang kuat ke PslG, protein kunci dalam jalur Psl. Namun, potensi interaksi CHX dalam jalur biofilm lainnya, seperti alginat, belum dieksplorasi. Studi ini mengeksplorasi potensi interaksi CHX dengan protein yang terlibat dalam jalur alginat pembentukan biofilm P. aeruginosa menggunakan reverse docking. Struktur delapan protein terkait alginat diambil dari Protein Data Bank. Struktur CHX diperoleh dari PubChem dan simulasi docking dilakukan menggunakan Fpocket dan SMINA untuk memprediksi afinitas pengikatan. Sebanyak 735 pose docking dihasilkan untuk protein terkait alginat yang dianalisis. Di antara ini, CHX menunjukkan afinitas pengikatan terkuat untuk alginat liase, enzim utama yang mendegradasi alginat dan telah terlibat sebagai target terapeutik untuk gangguan biofilm. Temuan ini menunjukkan bahwa CHX dapat memberikan efek anti-biofilm dengan menargetkan matriks alginat melalui alginat liase, yang berpotensi meningkatkan degradasi biofilm. Mengingat aplikasi alginat liase yang menjanjikan dalam strategi pengendalian biofilm, interaksi antara CHX dan alginat liase memerlukan validasi eksperimental lebih lanjut untuk mengeksplorasi dampak terapeutiknya dalam pengaturan klinis.
Penulis : Mohammad Subkhan, Sukardiman, Isnin Anang Marhana, Laily Irfana
Link :
