51¶¯ÂþÌý merupakan fakultas yang terus melaju dalam melakukan riset genomik dan bioinformatik khususnya di bidang bioinformatik kedokteran. Salah satu dosen di fakultas ini, dr. Firman Setiawan, Sp.MK., Ph.D. Ìýmendapat kesempatan untuk mengikutiÌýThe Asia-PasificÌý(´¡±Ê´¡°ä)ÌýPopulation-Genomics, Informatics, and Interpretation WorkshopÌý2023Ìýdi Thailand. Diselenggarakan oleh Oxford Nanopore Technology, dan didukung oleh Satriabudi Dharma Setia Foundation. WorkshopÌýdilaksanakan diÌýThailand Science Park Convention Center,ÌýThe National Science and Technology Development AgencyÌý(NSTDA), ÌýRangsit, Bangkok, Thailand, pada tanggal 15-16 Maret 2023.
Workshop yang mengundang peserta dari para ilmuwan dan peneliti genomik di Asia-Pasifik dan pembicara dari UK tersebut memberikan kesempatan yang sangat baik untuk memahami permasalahan sekuensing long-read genom manusia dengan platform Oxford Nanopore Technology (ONT) dan bagaimana mengatasi berbagai permasalahan; memahami struktur data ONT dan perbedaannya dari analisis short reads; dan menyiapkan alur kerja untuk analisis variasi genetika manusia dan penyakit menular, termasuk di dalamnya adalah analisis Single Nucleotide Variant (SNV)/indels, Copy Number Variations (CNV) dan Short Tandem Repeat (STR), metagenomic, transcriptomes, genome Sarcov2, genome Tuberculosis dan lain-lain. Selain itu, peserta workshop mendapat kesempatan mendengarkan presentasi NIVDIA, tentang dukungan mereka dengan merancang unit pemroses grafis untuk studi genomik skala besar.
Pada hari ke-2, peserta workshop diajak berkeliling di Innovation Cluster NSTDA, salah satunya mengunjungi NSTDA Supercomputer Center (ThaiSC) dan melihat Supercomputer LANTA System. LANTA System merupakan infrastruktur penting untuk pengembangan ilmu pengetahuan. Dukungan pendanaan tersebut dialokasikan dari Science, Research and Innovation Fund pada tahun 2021 untuk membangun sistem superkomputer yang menyediakan sumber daya komputasi berkinerja tinggi mutakhir untuk komunitas riset Thailand dan mendukung studi di bidang ilmu komputasi, analitik data, dan kecerdasan buatan (AI). LANTA merupakan sistem pertama di Thailand yang mengadopsi teknologi pendingin cair yang lebih hemat energi daripada sistem berpendingin udara, membawa Thailand ke era komputasi hijau. Superkomputer LANTA System siap untuk mendukung beragam penelitian di domain publik dan pribadi, berkontribusi pada inovasi di berbagai bidang termasuk kedokteran presisi, penemuan obat, prakiraan cuaca real-time berdasarkan citra satelit, desain material baru, pemodelan molekuler, keanekaragaman hayati, artificial intelligent (AI), dan analitik Big Data.
Kesempatan penting di akhir kegiatan adalah berdiskusi membangun jejaring kolaborasi dan mendapatkan manfaat dari pengalaman tim bioinformatika dari beberapa institusi di Asia-Pasific untuk nantinya dapat berkontribusi bersama pada kemajuan penelitian genomik di bidang kedokteran khususnya di Indonesia. MAN
