Penelitian tentang liquid smoke atau asap cair, khususnya yang berasal dari sekam padi, sebagai agen terapeutik melawan COVID-19 menunjukkan uji awal yang menjanjikan. Dalam publikasi terbaru, 2 kandungan dalma liquid smoke sekam padi yaitu 6-Octadecenoic dan Oleic Acid menunjukkan aktivitas yang signifikant dalam menghambat protease utama yaitu 6LU7 dari virus penyebab COVID-19 yaitu SARS-CoV-2. 6LU7 adalah penanda untuk struktur kristal dari protease utama (Mpro) virus SARS-CoV-2, yang juga dikenal sebagai 3C-like protease (3CLpro). Protease ini merupakan enzim penting dalam proses replikasi virus. Enzim ini bertanggung jawab untuk memproses poliprotein virus yang ditranslasikan dari RNA virus, yang penting bagi virus untuk membentuk virus baru. Menghambat protease ini dapat mengganggu replikasi virus, menjadikannya target utama untuk pengembangan obat antivirus. Struktur 6LU7 telah banyak dipelajari untuk merancang inhibitor yang dapat mengikat dan menghambat fungsi enzim ini secara efektif.
Dalam penelitian sebelumnya diketahui bahwa enam senyawa dalam kandungan liquid smoke sekam padi yaitu phenol, mequinol, 2-methoxy-phenol, 6-octadecenoic acid, oleic acid, 9-octadecenoic acid memiliki interaksi terhadap 6LU7. Lebih lanjut phenol, 2-methoxy-phenol, mequinol, dan asam 9-octadecenoic acid memiliki energi bebas pengikatan yang lebih tinggi yang menyebabkan sulit untuk berikatan dengan situs aktif protein 6LU7. Sebaliknya 6-Octadecenoic dan Oleic Acid memiliki energi bebas pengikatan dan faktor pengikatan yang lebih besar, yang diduga sebagai penghambat aktif COVID-19.
Potensi terapeutik liquid smoke sekam terhadap COVID-19 berakar pada komposisi kimiawinya yang kompleks, yang memungkinkannya berinteraksi secara efektif dengan protein virus. Protease utama (3CLpro atau Mpro) dari SARS-CoV-2 adalah enzim esensial yang memproses poliprotein virus yang diperlukan untuk replikasi virus. Dengan menghambat protease ini, adalah mungkin untuk mengganggu siklus hidup virus, menjadikan Mpro target utama untuk pengembangan obat antivirus. Afinitas pengikatan dan dinamika interaksi asam 6-Octadecenoic dan Oleic Acid dengan Mpro dipelajari melalui metode in-silico, termasuk docking molekuler dan simulasi molecular dynamic (MD). Hasil lebih lanjut menunjukkan bahwa Interaksi asam 6-Octadecenoic dan Oleic Acid dengan Mpro dikonfirmasi oleh simulasi MD, menunjukkan stabilitas selama periode simulasi 50 ns pada 300 K. Interaksi ikatan hidrogen antara senyawa-senyawa ini dan protein target kuat, dengan jarak ikatan kurang dari 2,9 脜 dan sudut antara 150掳 dan 180掳, yang menunjukkan interaksi yang kuat dan spesifik.
Temuan ini menunjukkan bahwa LSRH, terutama komponennya asam 6-Octadecenoic dan Oleic Acid, dapat menjadi dasar untuk pengembangan obat antivirus baru yang menargetkan SARS-CoV-2. Diperlukan uji secara in-vitro da in-vivo mengenai potensi terapi liquid smoke sekam padi pada COVID-19. Dengan pengembangan ini tidak hanya memberikan nilai terapeutik baru melainkan meningkatkan nilai ekonomis dari liquis smoke.
Penulis: Ira Arundina dan Meircurius Dwi Condro Surboyo
Link:
