Newcastle Disease Virus (NDV) adalah sebagai penyebab penyakit tetelo pada hewan sebangsa unggas seperti ayam, burung, bebek, angsa, menthok. Virus ND mempunyai beberapa protein yang mempunyai fungsi berbeda seperti protein hemagglutinin (HA) yang mempunyai peranan untuk menempel reseptor pada permukaan sel membrane, sementara protein fusion (F) yang mengatur patogenesa virus dalam sel yanga terinfeksi.
Hasil penelitian ini memberikan informasi tentang kejadian penyakit ND pada ayam kampong yang dikenal dengan gallus gallus domesticus di Surabaya. Pendekatan untuk mengetahui fungsi dari protein F dengan cara Reverse Transcriptation Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) dengan menggunakan primers spesifik untuk gen pengkode protein F yang setelah dilakukan amplifikasi telah mendapat berat molekul 976 base paar (bp).
Analisis sekuensing dari F protein menunjukkan bahwa ditemukan homology antara Chc/SBY1/2018 dan Beaudate 80% dengan susuan asam amino 揜EFSEQ. tetapi jika dibandingkan dengan Lasota vaksin hasil sekuensing menunjukkan homologi 90% yang berarti similar. Sisi lain kejadian penyakit Newcatle Disease dilapangan masih tinggi dan mempunyai kemiripan dengan vaksin yang kebanyakan digunakan di Indonesia, walaupun kesamaan masih tinggi tetapi tidak berarti patogenitasnya sama tetapi perbedaan 10% memunyai arti penting dalam infeksiusitas virus ND. Berdasarkan temuan diatas redesain vaksin NDV perlu dikaji ulang.
Berdasarkan hasil analisis kekerabatan atau filogenetik menunjukkan bahwa isolate Cch/SBY 1/2018 adalah virus ND yang mempunyai sifat stabil. Hal ini ditunjukkan posisi isolate ND Surabaya sebagai virus ND yang mempunyai sifat sama dengan tahun 2012 di berbagai daerah dipulau Jawa sebagai varian ND yang mucul setelah virus ND yang beredar di Jakarta. Hasil temuan penelitian ini menunjukkan bahwa Chc/SBY 1/2/2018 adalah virus lama yang berada dilingkungan tetapi jarang menginfeksi hewan lain sehingga tidak banyak ditemukan adanya mutasi atau evolusi. Oleh karena itu isolate Surabaya sangat baik untuk dijadikan sebagai vaksin ND di Indonesia.
Berdasarkan analisis jarak kekerabatan (distance) menunjukkan adanya nilai distance 8,1% dibandingkan dengan strain Lasota, hasilnya tentu tinggi karena strain virus ND berbeda, sementara itu berdasarkan analisis distance yang dibandingkan dengan isolate referen menunjukan nilai 3,5% – 5% yang berarti lebih rendah dengan tingkat patogenisitasnya tetapi sifat virus ND yang bersirkulasi dilapangan tetap tinggi karena Indonesia sebagai negara endemis terhadap virus ND. Kemungkinan lain HAN lebih dominan dibandingkan dengan F protein, dan susunan asama amino pada daerah splicing protein fusion (F) tidak banyak mengalami mutasi.
Virus ND adalah virus yang mempunyai genom RNA yang bersifat labil atau high rate mutation yang kemungkinan memberikan celah terjadinya insersi atau substitusi sehingga sifat virulensi berubah. Hal ini sangat mudah terjadi karena memungkinkan adanya mixing variants baru. Tetapi keuntungan dengan virus ND mempunyai sifat cross protection, sehingga penyakit ini dapat dengan mudah dilakukan pencegahan (preventive) dengan pemberian vaksin sesuai program vaksinasi. Berdasarkan hasil penelitian terdahulu bahwa variant baru yang sering ditemukan adalah varian mixing antara virus vaksin dengan virus yang beredar secara alami, sehingga membawah gejalah klinik yang berbeda.
Hasil lain dari temuan penelitian menunjukkan adanya translasi nukleotida menjadi asam amino terjadi pergeseran pada struktur asam amino. Adanya pergeseran asam amino sangat dipengaruhi oleh environment dan micro environment, selain itu juga kemungkinan terjadi insersi nukleotida diantara vaksin strain Lentogenik dan strain mesogenik sehingga muncul virus baru yang mempunyai sifat kedekatan antara strain lentogenik dan mesogenik dan new strain tersebut sebagai virus ND yang banyak bersirkulasi dilapangan.
Penulis: Prof. Dr. Fedik Abdul Rantam, drh.
Sumber Pustaka: Maha Kirana1, Fedik Abdul Rantam2, Rahaju Ernawati2, Jola Rahmahani2. 2022. Karakterisasi Gen Pengkode Fusion Protein Virus Newcastle Disease pada Ayam Kampung di Surabaya (Characterization of Gene Coding Fusion Protein of Newcastle Disease Virus Infected in Native Chicken in Surabaya). Jurnal Medik Veteriner. DOI:
