UNAIR NEWS – Pneumonia terkait ventilator (VAP) yang disebabkan oleh Pseudomonas aeruginosa menimbulkan tantangan klinis yang signifikan karena pembentukan biofilm dan mekanisme resistensinya yang kuat. Klorheksidin (CHX), agen antiseptik, telah menunjukkan potensi dalam menghambat pembentukan biofilm, meskipun mekanismenya belum sepenuhnya dipahami. Untuk menjelaskan mekanisme kerja dan potensi klorheksidin dalam mengurangi pembentukan biofilm, kami melakukan analisis reverse docking yang menargetkan protein quorum-sensing utama dalam P. aeruginosa. Struktur protein dari enam protein quorum sensing dan biofilm diperoleh dari Protein Data Bank.
Struktur CHX diambil dari PubChem dan disiapkan untuk docking. Kantong pengikat potensial dalam struktur protein diidentifikasi menggunakan Fpocket, dan simulasi docking dilakukan dengan SMINA. Kami menghasilkan 395 pose docking di semua protein. Afinitas pengikatan tertinggi diamati pada PslG. Selain itu, afinitas pengikatan CHX yang tinggi dengan RhlR dan LasR menunjukkan potensinya untuk mengganggu jalur penginderaan kuorum. CHX menunjukkan afinitas pengikatan yang kuat terhadap protein penginderaan kuorum utama, khususnya PslG, RhlR, dan LasR. Hal ini menunjukkan bahwa CHX dapat mengganggu pembentukan biofilm dan penginderaan kuorum pada P. aeruginosa.
Penulis : Mohammad Subkhan, Sukardiman, Isnin Anang Marhana, Laily Irfana
Link : file:///Users/unair/Downloads/EcSWWVyrEsEkhvS.pdf
